Berdasarkan Peraturan Pimpinan Pusat Muhammadiyah Nomor 01/PRN/I.0/B/2012 tentang Majelis Pendidikan Tinggi

Majelis sebagai penyelenggara amala usaha, program, dan kegiatan bidang pendidikan tinggi sesuai kebijakan Persyarikatan bertugas:

1. membina ideologi Muhammadiyah;
2. mengembangkan Al-Islam dan Kemuhammadiyahan;
3. merencanakan, mengorganisasikan, mengkoordinasikan, membina, dan mengawasi pengelolaan catur dharma perguruan tinggi;
4. meningkatkan kualitas dan kuantitas perguruan tinggi;
5. melakukan penelitian dan pengembangan bidang pendidikan tinggi;
6. menyampaikan masukan kepada Pimpinan Persyarikatan sebagai bahan pertimbangan dalam penetapan kebijakan

Majelis sebagai penyelenggara amal usaha, program, dan kegitan bidang pendidikan tinggi sesuai kebijakan Persyarikatan berfungsi dalam:

1. pembinaan ideologi Muhammadiyah;
2. pengembangan Al-Islam dan Kemuhammadiyahan;
3. perencanaan, pengorganisasian, pengkoordinasian, pembinaan, dan pengawasan atas pengelolaan catur dharma perguruan tinggi;
4. peningkatan kualitas dan kuantitas tenaga profesional;
5. pengembangan kualitas dan kuantitas perguruan tinggi;
6. penelitian dan pengembangan bidang pendidikan tinggi;
7. penyampaian masukan kepada Pimpinan Persyarikatan sebagai bahan pertimbangan dalam penetapan kebijakan.